La primera planta del museu està dedicada a la col·lecció municipal. Amb la valoració i l'exposició pública de la col·lecció de les peces originals: obres pictòriques, fotografies, objectes simbòlics i restes arqueològiques. S’hi presenta un recorregut a través de la història i l’art de la ciutat i els esdeveniments més decisius de la Seu d’Urgell, des de l’edat dels metalls i l’origen mitològic de la ciutat per part d’Hèrcules, passant per l'esplendor medieval, les guerres de l’època moderna i les llums i ombres de l’època contemporània, fins als nostres dies. 

L'exposició, en diferents idiomes, es complementa amb audiovisuals que aprofundeixen en aspectes històrics i artístics addicionals.

Es tracta d’una exposició monogràfica sobre l’elaboració del formatge i sobre els formatges urgellencs, entre els quals destaquen el formatge tradicional de “casa” –el serrat d’ovella– i el formatge Alt Urgell –Cerdanya (DOP)–, elaborat per la Cooperativa Cadí.

El recorregut expositiu explica el procés de producció dels productes làctics del nostre territori a través de peces originals i fotografies. A més, presenta una instal·lació sobre el tast, composta per una selecció de joc d’olors dels principals tipus de formatges. També es posa  la importància de la Fira de Sant Ermengol (primera fira peninsular documentada en un privilegi del 1048) que, cada any des de 1995, celebra la Fira de Formatges Artesans del Pirineu, una mostra que ha aconseguit convertir-se en un fòrum de referència de l'artesania alimentària de qualitat.

Inclou també un nou audiovisual: Història de la producció lletera a l'Alt Urgell subtitulat en 4 idiomes i incorpora la interpretació de llengua de signes (LS) en català d'una durada de 8 min.

L’àtic de l’Espai Ermengol, i amb unes fantàstiques vistes sobre la catedral, la seu i el Cadí de fons, acull una exposició dedicada al patrimoni natural de l’Alt Urgell.

Consta de tres plafons de grans dimensions i d’una pantalla tàctil on es pot trobar informació detallada de l’inventari del patrimoni natural de la comarca. El primer dels plafons està dedicat als principals actius del patrimoni natural de l’Alt Urgell, entre els quals destaquen el centenar d’arbres catalogats, les més de 170 espècies d’ocells que es poden trobar a la comarca, les importants poblacions d’isard i cérvol i els jaciments paleontològics, entre d’altres. Al segon plafó s’expliquen els espais naturals protegits, entre els quals destaquen els dos parcs naturals, el del Cadí-Moixeró i de l’Alt Pirineu. Finalment, el tercer plafó està dedicat als aprofitaments turístics del patrimoni natural.

A través d’un seguit de plafons explicatius (en català i en anglès), el visitant coneixerà els núvols, les muntanyes i els vessants nord i sud del Pirineu; els vents i les muntanyes; la relació de la vegetació i la fauna amb el clima; el glacialisme; les tempestes i consells sobre què cal fer si ens sorprèn una tempesta a la muntanya, i un especial sobre allaus. Aquesta exposició es complementa amb 15 audiovisuals que es poden seguir a la sala contigua de la mateixa planta que ocupa la mostra.

A la planta superior hi ha un mirador amb vistes excepcionals sobre la Catedral, el nucli antic de la ciutat i la serra del Cadí.

La sala polivalent de la tercera planta de l'Espai Ermengol és un espai complementari al museu amb l'objectiu de reforçar les exposicions temporals amb material audiovisual, donant cabuda a tot un seguit d'activitats variades en petit format com: tallers i activitats educatives, conferències, formacions i presentacions, degustacions, entre d'altres.

Disposa de projector i equip de so.

Accessible per a persones amb discapacitat física.

Visita guiada pel centre de la ciutat, on ens endinsarem en la vida de la societat urgellenca del segle XIX, a través del comerç, l’economia i els costums dels qui hi habitaven en aquesta època.